摘要:基于零模型的微生物群落构建过程判别方法et al.(Stegen et al., 2013) 已被广泛运用于多种生境中微生物群落构建机制的研究。在微生物地理学研究中,该方法的直接结果能反映各种生态过程在研究区域中的相对比例。但是,如不进一步对群落构建过程的地理空间分布格局进行表征,则会使得对微生物群落构建机制的认识趋于笼统化。本教程详述了应用ArcGIS等软件将成对样点间微生物群落构建过程映射到地图的分析流程,不仅能展示各种生态过程的相对重要性,同时能清晰表征其在整个研究区域的地理空间分布格局,从而加深研究者对微生物群落构建过程空间异质性的认识。
关键词: 微生物群落, 群落构建, 空间分布, 可视化
仪器设备
个人电脑 (安装Windows 10操作系统)
软件
实验步骤
Stegen零模型方法的最终计算结果为βNTI (β-Nearest Taxon Index,最近种间指数) 和RCBray (基于Bray-Curtis非相似性的Raup-Crick指数) 数值矩阵 (Stegen et al., 2013),能反映主导成对样本间微生物群落周转的各种生态过程,即群落构建过程。将成对采样站位之间的微生物群落构建过程映射在地图上,即可反映出研究区域中各种生态过程的地理空间分布格局。本教程用成对站位间不同颜色的连线来表示站位间的各类生态过程,操作步骤如下:
致谢
本项工作得到了国家自然科学基金委员会 (项目编号:41977192) 的资助。
参考文献
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