材料和试剂
对于清洁发展机制
1. 12孔板
2. 培养的成纤维细胞 [例如，端粒酶永生化成纤维细胞 (TIF) 或 CAF]
3. 胰蛋白酶/EDTA 溶液（Life Technologies，目录号：15400）
4. 成纤维细胞生长培养基[特定于成纤维细胞系；例如，对于 TIF：添加 10% FBS 的 DMEM（Thermo Fisher Scientific，目录号：11995065）]
5. 磷酸盐缓冲盐水（PBS）（Life Technologies，目录号：14190）
6. 明胶（Sigma-Aldrich，目录号：G1393），储存于 4 °C
7. 10% 中性缓冲福尔马林（ Australian Biostain P/L，目录号：ANBFC.10L）
8. 甘氨酸（ Sigma-Aldrich ，目录号：G7126）
9. (+)-L-抗坏血酸钠（Sigma-Aldrich，目录号：A7631），新鲜制作
10. DNase I（Roche，目录号：05025），等分并储存在 -20 °C（不要冻融）
11. Fungizone（两性霉素 B，Life Technologies，目录号：15290）
12. 青霉素/链霉素（pen/strep）（Thermo Fisher Scientific，目录号：15070-063）
13. 70% 乙醇
14. 0.2% 无菌明胶（见食谱）
15. 1 M 无菌甘氨酸（见食谱）
16. 抗坏血酸 (1,000 × )，新鲜制备（见食谱）
17. 提取缓冲液（参见配方）
a. Triton X-100（ Sigma-Aldrich ，目录号：9284）
b. 氢氧化铵
c. 脱氧胆酸钠（Sigma-Aldrich，目录号：D6750）
18. 补充 PBS（见食谱）
a. 氯化钙（Chem Supply，目录号：CA033）
b. 硫酸镁（Chem Supply，目录号：MA048）
19. 用抗生素和抗真菌剂补充 PBS （见食谱）

天狼星红染色
20. 0.1% 天狼星红染色剂（Abcam，目录号：ab150681）
21. 磷钼酸水合物（Sigma-Aldrich，目录号：221856）
22. 冰醋酸（Chem Supply，目录号：AA009-2.5LP）
23. 反渗透 (RO) 水
24. 0.02% 磷钼酸（见配方）
25. 10% 磷钼酸原液（见配方）
26. 酸化水（见食谱）

设备

1. 12 孔玻璃底培养皿（Celvis，目录号：D35-20/4.5N）
2. 无菌玻璃瓶（用于储存明胶、提取缓冲液和甘氨酸）
3. 天狼星红染色试剂盒（Australian Biostain，APSRA，500 mL）

软件

1. TWOMBLI（Wershof 等人，2021 年）： https ://github.com/wershofe/TWOMBLI
2. FibrilTool（Boudaoud 等人，2014 年）： https ://www.quantitative-plant.org/software/fibriltool
3. 自动 ECM 纤维定向和对齐（Mayorca-Guiliani 等人，2017 年）： https ://github.com/TCox-Lab/Collagen_Orientation
4. 使用偏振光自动进行苦天狼星红和胶原蛋白双折射分析（Vennin 等人，2019 年）： https ://github.com/TCox-Lab/PicRed_Biref
5. Cell Tracker (not only) for Dummies (Piccinini et al., 2016): http://celltracker.website/about-celltracker.htmL

程序

A. 在无菌组织培养条件下，制备组织培养玻璃底皿

注意：虽然这一步不是绝对必要的，但建议将矩阵锚定到盘子的玻璃表面。
1. 用 1 mL 的 0.2% 无菌明胶涂上玻璃底盘（在 12 孔板中），并在 37°C 下孵育 60 分钟。
2. ° C) PBS洗碗两次。
3. 用 1 mL 的 10% 中性缓冲福尔马林交联明胶层，并在室温下孵育 30 分钟。
4. 用温暖的 (37 ° C) PBS 洗涤两次。
5. 通过添加 1 M 无菌甘氨酸并在室温下孵育 20 分钟来淬火福尔马林交联剂。
6. 用温暖的 (37 ° C) PBS 洗涤两次。
7. 将生长介质添加到培养皿中，并在 37°C 下孵育 30 分钟。
8. 立即使用或储存在含有 2.5 µg/mL fungizone 和 5% pen/strep 的补充 PBS 中，用封口膜密封以防止蒸发长达四个星期。
存放涂层餐具后：
a. 用温暖的 (37 ° C) PBS洗涤两次。
b. 在进行程序 B 之前，将生长培养基添加到培养皿中并在 37°C 下孵育 30 分钟。

B. 电镀成纤维细胞和基质生产

注意：这将因细胞类型而异。
1. 根据特定细胞系的既定方案分离和收获成纤维细胞。
2. 适当稀释成纤维细胞和平板：
这将根据成纤维细胞类型以及细胞系是否克服了增殖的接触抑制而有所不同。对于接触后停止生长的细胞系，例如 TIF，应铺板适当的细胞数以在 12 – 24 小时内达到 90 % – 100% 汇合。对于接触后继续生长的细胞系，例如胰腺癌 CAF（Vennin等人， 2019），应接种适当的细胞数以在 12 – 24 小时内达到 30% – 40% 的汇合度。这应该在每个成纤维细胞系的实验之前确定。例如，TIF 应在补充抗坏血酸前一天以每孔 2.5 × 10 5 个细胞接种在 12 孔板中，以便在六天后获得 CDM（另请参见图 1e）。
3. 在 37°C 下过夜培养成纤维细胞。氧含量取决于所使用的特定细胞系。
4. 如果适用，用补充有 50 µg/mL 抗坏血酸和适当药物的新鲜生长培养基替换培养基。
a. 治疗时间会因成纤维细胞类型而异：对于在接触后停止生长的细胞系，请等到细胞汇合后再开始治疗。如果细胞在接触后继续生长，则在细胞达到 30% – 40% 汇合时开始处理。这应该针对每个成纤维细胞系来确定。
b. 对于某些成纤维细胞系，在补充的第 1 天用 100 – 500 µg/mL 的抗坏血酸进行处理是有益的，然后切换到 50 µg/mL 以增加基质厚度。这应该在实验前针对每个细胞系单独确定。
5. 每隔一天更换一次抗坏血酸培养基。如果用药物治疗细胞，请同时更新药物和抗坏血酸。
对于需要条件培养基的细胞系，用补充有 100 µg/mL 抗坏血酸的新鲜培养基去除和补充一半的培养基体积，以达到 50 µg/mL 的最终浓度。
6. 培养 6 – 10 天，具体取决于基质生产率。
待开发的矩阵越长，它们分离的可能性就越大。在实验之前，应为每个独立的成纤维细胞系确定理想的培养和基质生产。建议使用时程分析来确定此时间范围。
从这里开始，CDM 可以用于 ECM 超微结构的分析（有关详细信息，请参阅数据分析）或剥除以去除成纤维细胞（图 1、2）。 ECM 超微结构分析在步骤 B7 中讨论。我们建议保持成纤维细胞完好无损，以确保维持成纤维细胞和基质的细胞-基质相互作用。
7. 通过成像或组织学染色分析 ECM：
a. 二次谐波生成 (SHG) 成像：在成纤维细胞完好无损的未固定基质上进行，以可视化纤维状胶原蛋白 I。
b. 天狼星红染色/双折射成像：在 10% 中性缓冲福尔马林中用完整的成纤维细胞固定基质过夜，然后在天狼星红染色前换成 70% 乙醇（按照制造商的说明，参见下面的步骤 i. – v.）和成像。 CDM 应立即成像。
i. 在 0.02% 磷钼酸中孵育 CDMS 2 分钟。
ii. 用反渗透 (RO) 水冲洗 3 次。
iii. 用 0.1% picrosirius 红色溶液染色 CDM 1 小时。
iv. 用酸化水冲洗两次（第一次洗 10 秒，第二次洗 2 分钟）。
v. 用 70% 乙醇冲洗三次（储存在 70% 乙醇中用于成像，不要让 CDM 变干）。
8. 要分析癌细胞与 CDM 的相互作用，请继续执行程序C和D。

C. 剥脱成纤维细胞

1. 吸出培养基并用 PBS 洗涤细胞两次。
2. 轻轻添加预热的提取缓冲液，足以覆盖细胞/基质层。
3. 溶解大约 2 分钟。
a. 细胞裂解几乎是瞬时的，但会因基质厚度而异。保留提取缓冲液，直到透射光显微镜看不到完整的细胞。
b. 不建议裂解超过 5 分钟，因为 CDM 很脆弱，在提取缓冲液中延长孵育时间会导致分离。从这一点开始，还建议不要再使用抽吸来更换介质和缓冲液。
4. 吸出提取缓冲液并用补充的 PBS 洗涤两次（参见食谱）。
5. 在补充的 PBS 中孵育 10 mg/mL DNase I，以尽量减少 CDM 中的 DNA 碎片。
6. 吸出 DNase 并用补充的 PBS 洗涤两次。
7. 立即使用或储存在 4°C 的补充 PBS 中，其中含有抗生素和抗真菌剂（笔/链球菌 5% 和 0.25 µg/mL 真菌区），用封口膜密封以防止蒸发长达两周。

D. 用于癌细胞电镀的裸基质的制备

1. 如果矩阵已被储存，让它们适应室温，然后用补充的 PBS 洗涤两次。否则，直接继续执行步骤 D3。
2. 根据 Franco-Barraza 等人的指示。 (2016)，如果您在癌细胞接种后进行抗体染色，建议用 BSA 封闭基质。否则，继续执行步骤 D3。
3. 在 37°C 下在癌细胞的适当生长培养基中孵育基质 30 分钟。
4. 以适当的密度去除培养基和种子癌细胞：
例如，使用来自 KPC ( Kras G12D/+ ；p53 R172H/+ ；Pdx-1Cre ) 胰腺癌小鼠模型的KPC 胰腺癌细胞，以 2.5 × 10 4的密度接种用于迁移测定或 1 × 10 5用于12 孔板的每孔生化测定。
5. 对于细胞迁移分析，可能需要进一步优化接种密度以跟踪单个细胞或集体细胞迁移；我们建议跟踪细胞 72 小时。

数据分析

通过成像或组织学染色分析 ECM：
1. SHG 成像以可视化纤维状胶原蛋白 I （图 2b）：
a. 使用多光子显微镜进行 SHG 成像 [激发调谐到 880 nm 波长，检测波长为 440 nm，如前所述（Vennin等人， 2017 年；Wu等人， 2020 年；Murphy等人， 2021 年）]，配备有精确的 z 控制能力，确保获得：
i. z-stacks（我们推荐 2.52 µm 步长，具有 512 µm × 512 µm 代表性视场，以 25 倍放大倍率和 4 线平均值获取）用于基于强度的分析；
ii. 用于矩阵超微结构分析的高分辨率单平面图像（1,024 µm × 1,024 µm 代表性视场，以 25倍放大倍率和 64 的线平均值获取）。
b. 分析 z 堆栈的 SHG 强度以确定我在深度样本中存在的交联胶原蛋白的数量，z 堆栈成像允许获得最大的 SHG 信号。
c. 然后可以通过以下方式处理高分辨率图像：
i. TWOMBLI，按照协议说明（Wershof等人， 2021 年，参见软件）。
ii. 自动 ECM 纤维取向和排列分析，以评估胶原纤维的分布和取向（Mayorca-Guiliani 等人，2017）。
d. 然后可以将 CDM 进行福尔马林固定并用天狼星红染色。
2. Picrosirius 红染色（图 2a；这可以在具有完整成纤维细胞的 CDM 上进行或剥除以减少背景）：
a. 在 20倍变焦下以高分辨率（我们推荐 1,024 × 1,024）执行偏振光成像（也可以获取明场图像，但偏振光可降低背景噪声并提供纤维图像以供进一步分析）。
b. 使用以下方法分析图像：
i. TWOMBLI，按照协议说明（Wershof等人， 2021 年，参见软件）。
潜在读数：高密度矩阵、端点、曲率、分形维数和分支点。
ii. 自动化 ECM 纤维定向和对齐（Mayorca-Guiliani等人， 2017）。
潜在读数：纤维方向和排列。
iii. 使用偏振光对胶原蛋白 I/III 进行自动化天狼星红和双折射分析（Vennin 等人，2019 年）。
潜在读数：纤维束的胶原蛋白沉积和成熟度；可以使用 TWOMBLI 进行进一步分析。
iv. ImageJ 上的 FibrilTool 插件（Boudaoud 等人，2014 年）。对于此工具，最好将图像分割成单独的感兴趣区域并分析每个区域，然后对每个图像的结果进行平均。
潜在读数：图像各向异性（组织）和胶原纤维分析。

用于分析癌细胞迁移：
3. 追踪单个癌细胞迁移：
a. 在剥离 CDM 和播种癌细胞后，随时间收集细胞迁移模式的视频，每隔 15 分钟拍摄一次（视频 1）。为了跟踪单个癌细胞迁移，我们建议使用低密度的细胞（从大约 5% 的汇合度开始，以确保随着时间的推移可以识别和跟踪单个细胞）。
使用 Cell Tracker（不仅针对）Dummies（Piccinini 等人，2016 年）分析单细胞迁移并绘制细胞迁移的极坐标图（我们建议使用内置的 Matlab 应用程序来获取细胞速度、方向、持久性和总距离）。

视频 1. KPC 细胞在 TIF 生成的 CDM 中迁移

4. 集体癌细胞迁移的跟踪：
a. 在剥离 CDM 和播种癌细胞后，每隔 2 小时收集一次细胞迁移模式的视频（视频 2）。我们建议使用中等密度的细胞（从大约 30% 的汇合度开始，以确保可以识别集体细胞模式）。
i. 通过将灰度图像转换为 ImageJ 中的二进制图像来分析集体细胞迁移。
ii. 使用 FibrilTool 分析二值图像 (Boudaoud et al., 2014)。对于此工具，最好将图像分割成单独的感兴趣区域并分析每个单独的区域，然后对每个图像的结果进行平均，以提供集体细胞迁移的整体分析。

视频 2. 跨 TIF 生成的 CDM 的 KPC 单元流
笔记

1. CDM 最好立即使用，而不是在长期储存后使用：在我们手中，SHG 信号强度最多可稳定三天，然后随时间降低。
2. CDM 生产过程中持续的细胞增殖会导致 CDM 从表面分离。对于尚未克服接触抑制的成纤维细胞产生 CDM，建议在 30% – 40% 汇合时开始补充抗坏血酸。
3. 当将成纤维细胞播种到涂有明胶的培养皿上时，一些原代成纤维细胞系对明胶涂层过程很敏感。在这里，我们建议在步骤 A7 中使用正常浓度两倍的 FBS 延长孵育时间，以确保细胞能够正确粘附在基底上。
4. 有关进一步的分析和方法，例如免疫荧光，也请参阅 Franco-Barraza 等人。 (2016)。

食谱

1. 0.2% 无菌明胶
试剂终浓度数量
明胶 0.2%（重量/体积） 8毫升
PBS 不适用 72 毫升
全部的不适用 80 毫升
*使用前过滤灭菌

2. 1 M 无菌甘氨酸
试剂终浓度数量
甘氨酸 1米 6克
PBS 不适用 80 毫升
全部的不适用 80 毫升
*使用前过滤灭菌

3. 抗坏血酸 (1,000 × )：新鲜制备
试剂终浓度数量
(+)-L-抗坏血酸钠 50 毫克/毫升 0.05毫克
PBS 不适用 1毫升
全部的不适用 1毫升
*使用前过滤灭菌

4. 提取缓冲液
试剂终浓度数量
海卫 X-100 0.5%（体积比） 400 微升
NH 4羟基 20毫米 1.6 毫升
脱氧胆酸钠 1%（体积/体积） 800 微升
PBS 不适用 77.2 毫升
全部的不适用 80 毫升
*使用前过滤灭菌

5. 补充 PBS
试剂终浓度数量
氯化钙 (CaCL 2 ) 1毫米 500 µL
硫酸镁 (MgSO 4 ) 1毫米 500 µL
PBS 不适用 499 毫升
全部的不适用 500 毫升
*使用前过滤灭菌

6. 用抗生素和抗真菌剂补充 PBS
试剂终浓度数量
笔/链球菌 100 单位/100 微克/毫升 5毫升
真菌地带 0.25 微克/毫升
PBS 不适用 495 毫升
全部的不适用 500 毫升
*使用前过滤灭菌

7. 10% 磷钼酸原液
试剂终浓度数量
磷钼酸水合物 10% 10克
蒸馏水不适用 100 毫升
全部的不适用 100 毫升

8. 0.02% 磷钼酸原液
试剂终浓度数量
磷钼酸 10% 库存 0.02% 4毫升
蒸馏水不适用 196 毫升
全部的不适用 200 毫升

9. 酸化水
试剂终浓度数量
冰醋酸 (17.4 M) 87.1 毫米/0.5% 5毫升
蒸馏水不适用 995 毫升
全部的不适用 1,000 毫升

致谢

这项研究得到了国家卫生和医学研究委员会 (NHMRC)、澳大利亚研究委员会 (ARC)、新南威尔士州癌症委员会、新南威尔士州癌症研究所 (CINSW)、澳大利亚癌症协会、Tour de Cure、圣文森特诊所基金会、澳大利亚政府研究机构的支持培训计划津贴、Baxter Family 研究生奖学金和 Suttons。这项工作是由 Avner 胰腺癌基金会（现为 PanKind）资助和 ACRF INCITe 中心促成的。 PT 得到 Len Ainsworth 胰腺癌研究奖学金的支持，是国家卫生和医学研究委员会 (NHMRC)。 KJM、BAP 和 DH 得到 CINSW 早期职业研究奖学金的支持。
该协议主要源自原始作品（ Cukierman等人，2001 年；Franco-Barraza等人， 2016 年；Murphy 等人，2021 年）。

利益争夺

PT 从 Kadmon Inc.、InxMed（顾问）、Redx Pharma、Équilibre Biopharmaceuticals 和 Amplia Therapeutics 获得试剂。根据 Amplia Therapeutics 和 Garvan 医学研究所之间的许可协议，KJM、DH 和 PT（顾问）有权获得里程碑付款。

参考

Boudaoud, A.、Burian, A.、Borowska-Wykret, D.、Uyttewaal, M.、Wrzalik, R.、Kwiatkowska, D. 和 Hamant, O.（2014 年）。 FibrilTool，一种 ImageJ 插件，用于量化原始显微镜图像中的纤维状结构。 Nat Protoc 9(2)：457-463。
Boyle, ST, Poltavets, V., Kular, J., Pyne, NT, Sandow, JJ, Lewis, AC, Murphy, KJ, Kolesnikoff, N., Moretti, PAB, Tea, MN 等。（2020）。 ROCK 介导的 PERK 信号选择性激活通过 CRELD2 依赖机制引起成纤维细胞重编程和肿瘤进展。 Nat Cell Biol 22(7)：882-895。
考克斯，TR (2021)。癌症中的基质。 Nat Rev Cancer 21(4)：217-238。
Cukierman, E. (2002)。培养的成纤维细胞产生的细胞外基质的制备。 Curr Protoc 细胞生物学16(1)：10.19.11-10.19.15。
Erami, Z., Herrmann, D., Warren, SC, Nobis, M., McGhee, EJ, Lucas, MC, Leung, W., Reischmann, N., Mrowinska, A., Schwarz, JP等。 (2016)。使用 E-钙粘蛋白-GFP 小鼠的活体 FRAP 成像揭示了活组织中细胞-细胞连接的疾病和药物依赖性动态调节。细胞代表14(1)：152-167。
Franco-Barraza, J.、Beacham, DA、Amatangelo, MD 和 Cukierman, E.（2016 年）。培养和原代成纤维细胞产生的细胞外基质的制备。 Curr Protoc 细胞生物学71(1)：10.19.11-10.19.34。
Mayorca-Guiliani, AE, Madsen, CD, Cox, TR, Horton, ER, Venning, FA 和 Erler, JT (2017)。 ISDoT：组织的原位去细胞化，用于天然细胞外基质的高分辨率成像和蛋白质组学分析。 Nat Med 23(7)：890-898。
Miller, BW, Morton, JP, Pinese, M., Saturno, G., Jamieson, NB, McGhee, E., Timpson, P., Leach, J., McGarry, L., Shanks, E., 等。 (2015)。靶向 LOX/缺氧轴可逆转许多使胰腺癌致命的特征：抑制 LOX 可消除转移并增强药物疗效。 EMBO 分子医学7(8)：1063-1076。
Morton, JP, Timpson, P., Karim, SA, Ridgway, RA, Athineos, D., Doyle, B., Jamieson, NB, Oien, KA, Lowy, AM, Brunton, VG, 等。（2010）。突变体 p53 驱动转移并克服胰腺癌的生长停滞/衰老。 Proc Natl Acad Sci 美国107(1)：246-51。
Murphy, KJ, Reed, DA, Vennin, C., Conway, JRW, Nobis, M., Yin, JX, Chambers, CR, Pereira, BA, Lee, V., Filipe, EC, 等。 (2021)。活体成像技术根据 Merlin 状态指导胰腺癌精准医学中 FAK 介导的启动。科学进阶7(40)：eabh0363。
Neesse, A.、Bauer, CA、Ohlund, D.、Lauth, M.、Buchholz, M.、Michl, P.、Tuveson, DA 和 Gress, TM (2019)。胰腺癌的基质生物学和治疗：为临床转化做好准备了吗？肠道68(1)：159-171。
Nicolle, R., Blum, Y., Marisa, L., Loncle, C., Gayet, O., Moutardier, V., Turrini, O., Giovannini, M., Bian, B., Bigonnet, M.,等。 (2017)。患者来源的异种移植物中肿瘤-间质串扰分析揭示的胰腺癌治疗靶点。细胞代表21(9)：2458-2470。
Özdemir , BC, Pentcheva-Hoang, T., Carstens, JL, Zheng, X., Wu, CC, Simpson, TR, Laklai, H., Sugimoto, H., Kahlert, C., Novitskiy, SV, 等。 (2014)。与癌相关的成纤维细胞和纤维化的耗竭会导致免疫抑制并加速胰腺癌的发展并降低生存率。癌细胞25(6)：719-734。
Cukierman , E.、Pankov, R.、Stevens, DR 和 Yamada, KM (2001)。将细胞-基质粘附带到三维空间。科学294(5547)：1708-1712。
Pereira, BA、Vennin, C.、Papanicolaou, M.、Chambers, CR、Herrmann, D.、Morton, JP、Cox, TR 和 Timpson, P.（2019 年）。 CAF 亚群：胰腺癌基质靶标的新储库。癌症趋势 5(11)：724-741。
Piccinini, F.、Kiss, A. 和 Horvath, P.（2016 年）。 CellTracker（不仅）用于假人。生物信息学32(6)：955-957。
Rath, N., Munro, J., Cutiongco, MF, Jagiello, A., Gadegaard, N., McGarry, L., Unbekandt, M., Michalopoulou, E., Kamphorst, JJ, Sumpton, D., 等人. (2018)。 AT13148 对 Rho 激酶的抑制作用可阻断胰腺导管腺癌的侵袭和肿瘤生长。癌症研究78(12)：3321-3336。
Rhim, AD, Oberstein, PE, Thomas, DH, Mirek, ET, Palermo, CF, Sastra, SA, Dekleva, EN, Saunders, T., Becerra, CP, Tattersall, IW 等。 (2014)。基质成分起到抑制而不是支持胰腺导管腺癌的作用。癌细胞25(6)：735-747。
Romani, P.、Valcarcel-Jimenez, L.、Frezza, C. 和 Dupont, S. (2021)。机械传导和新陈代谢之间的串扰。 Nat Rev Mol 细胞生物学22(1)：22-38。
Sahai, E., Astsaturov, I., Cukierman, E., DeNardo, DG, Egeblad, M., Evans, RM, Fearon, D., Greten, FR, Hingorani, SR, Hunter, T., 等。（2020）。促进我们对癌症相关成纤维细胞的理解的框架。 Nat Rev Cancer 20(3)：174-186。
Vennin, C., Chin, VT, Warren, SC, Lucas, MC, Herrmann, D., Magenau, A., Melenec, P., Walters, SN, Del Monte-Nieto, G., Conway, JR 等人. (2017)。通过 ROCK 抑制的瞬时组织启动解除了胰腺癌的进展、对化疗的敏感性和转移。科学翻译医学9(384)。
Vennin, C.、Melenec, P.、Rouet, R.、Nobis, M.、Cazet, AS、Murphy, KJ、Herrmann, D.、Reed, DA、Lucas, MC、Warren, SC 等。（2019）。由胰腺癌细胞 p53 状态驱动的 CAF 层次结构通过 perlecan 创造了一个促转移和化学耐药的环境。 Nat Commun 10(1)：3637。
Wershof, E.、Park, D.、Barry, DJ、Jenkins, RP、Rullan, A.、Wilkins, A.、Schlegelmilch, K.、Roxanis, I.、Anderson, KI、Bates, PA 和 Sahai, E. (2021)。用于量化细胞外基质模式的 FIJI 宏。生命科学联盟4(3)。
Wu, SZ, Roden, DL, Wang, C., Holliday, H., Harvey, K., Cazet, AS, Murphy, KJ, Pereira, B., Al-Eryani, G., Bartonicek, N., 等人. （2020）。与人类三阴性乳腺癌免疫逃避相关的基质细胞多样性。 EMBO J 39(19)：e104063。