摘要：识别具有活性的前噬菌体，对于研究噬菌体和细菌的协同进化、噬菌体的生理生化以及工程化设计噬菌体等多种用途至关重要。这里，我们介绍了Prophage Hunter，该工具旨在从细菌的全基因组序列中寻找具有活性的前噬菌体。结合序列相似性的匹配及基于遗传特征的机器学习分类模型，我们开发了一种新颖的评分系统，该系统在验证数据集上预测活性前噬菌体中表现出比当前工具更高的准确性。该工具也可以选择跳过序列相似性匹配，这样有更多可能发现新颖的前噬菌体。Prophage Hunter提供一站式网站服务，包括从细菌基因组中提取前噬菌体基因组、评估前噬菌体的活性、鉴定系统发育相关的噬菌体、注释噬菌体蛋白的功能及可视化前噬菌体基因组位置信息等。Prophage Hunter可在https://pro-hunter.genomics.cn/免费使用。

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