摘要:微生物生物地理研究对于理解微生物多样性的形成和维持机制至关重要。目前高通量测序的突破为我们探究微生物地理分布格局提供了支持。本文以河西走廊森林土壤细菌的地理分布研究为示例,从纬度多样性模式、
alpha-多样性的影响因子、群落结构的影响因子、距离衰减关系和群落生态过程等研究方法入手,阐述河西走廊森林土壤细菌的生物地理分布模式和群落构建机制,给出了微生物生物地理分布的常见研究方法和分析流程,为研究微生物生物地理学提供了科学案列和参考。
研究背景
生物地理学是一门研究生物多样性在空间和时间上分布格局的生物学与地理学交叉学科,主要探究生物群落的组成、分布和形成原因。生物地理学的研究为生物多样性的形成和维持机制提供了见识,例如物种形成,灭绝,扩散和物种相互作用,并且有助于预测生态系统功能随环境的变化。生物地理学按照生物群落可以划分为植物生物地理、动物生物地理和微生物生物地理。当前,随着高通量技术的发展,微生物生物地理学迎来了发展机遇。
仪器设备
- 普通个人电脑
软件
- R (v3.6.2),所需依赖包:ggplot2、reshape2、patchwork、vegan、geosphere、psych、corrplot和pacman。
实验步骤