Improve Research Reproducibility A Bio-protocol resource

湖泊沉积物的野外采集方法

Field Sampling Method of Lake Sediment

胡 胡婷
朱 朱立峰
王 王建军

发表时间: 2021年04月25日 DOI: 10.21769/BioProtoc.2003789 浏览次数: 4311

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微生物组实验手册：架起各领域通向微生物组世界的桥梁
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摘要：湖泊河流等水体生态系统的沉积物富含微生物资源，对生物地球化学循环和生物多样性的维持起着非常重要的作用。采集的沉积物能否反映采样位点的真实情况对科研结果有着不可忽视的影响。本方法详细的描述了湖泊沉积物野外采样的前期准备工作、采样区域勘查工作、原位样本采集工作以及样品的分割和保存工作。利用重力柱状采泥器，可采集湖泊中小于100 cm深的沉积物，并对沉积物样品进行分层处理以用于后期的沉积物理化因子及微生物分析，以及用来研究不同深度的沉积物中微生物的多样性和群落结构，为微生物群落在湖泊沉积物中的垂向分布及其介导的元素地球化学循环提供理论依据。深水 (水深大于6 m) 区域，可安装尾翼和配重，连接绳索，防止重力柱状采泥器掉入水中丢失。该方法适用于采集河流、湖泊、池塘的水下沉积物 (底泥、底质、污泥)、沼泽土和泥碳土。

Keywords: 湖泊 search 沉积物 search 微生物群落 search 采泥器 search 野外采样 search

材料与试剂

  1. 20 ml塑料采样瓶 (koraba)
  2. 7号 (110 mm x 160 mm x 0.08 mm) 无菌聚乙烯自封袋 (美翔牌)
  3. 12号 (340 mm x 450 mm x 0.08 mm) 无菌聚乙烯自封袋 (美翔牌)
  4. 一次性小勺 (10 cm x 2 cm)
  5. 小刀 (得力)
  6. 无菌乳胶手套和橡胶手套 (海门市扬子医疗器械有限公司)
  7. 便携式可调节救生衣 (江苏梅卡瓦安防科技有限公司，catalog number: 5564-1)
  8. 长筒水鞋 (旭升塑胶制品有限公司，catalog number: 3531)
  9. PVC收纳箱 (得力)
  10. 笔记本 (得力)
  11. 圆珠笔、2B铅笔、中性笔、防水马克笔、防磨马克笔 (得力)
  12. 75%酒精 (南京化学试剂股份有限公司)
  13. 烧杯 (SHUNIU，500 ml)
  14. 保鲜袋和保鲜膜 (妙洁)
  15. 便签纸 (得力)

仪器设备

  1. 立式蒸汽灭菌器 (江苏登冠医疗器械有限公司，力辰科技，model: DGL-35B)
  2. 电热恒温鼓风干燥箱 (上海森信实验仪器有限公司，model: DGG-9053A型)
  3. 车载冰箱 (MOBICOOL, model: C18 DC) 或者小型液氮罐
  4. 手持水深自动测量仪 (北京宇艾奇电子科技有限公司，model: SQ008134)
  5. 手持GPS定位仪 (GARMIN，GPSMAP 631sc) 和7号电池 (南孚)
  6. 冷冻干燥机 (北京博医康实验仪器有限公司，model: FD-1A-50)
  7. 重力柱状采泥器 (配有采样管、延长杆、顶锤、绳索、刮刀和尾翼配重)
  8. 智能手机 (HUAWEI P40 Pro)
  9. 个人电脑 (HUAWEI MateBook14)

软件

  1. Microsoft Office Excel (v2019)
  2. ArcGIS (v10.2)


实验步骤

Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：胡婷, 朱立峰, 王建军. (2021). 湖泊沉积物的野外采集方法. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003789. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003789.
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How to cite: Hu, T., Zhu, L. F. and Wang, J. J.  (2021). Field Sampling Method of Lake Sediment. // Microbiome Protocols eBook. Bio-101: e2003789. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003789.
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分类

系统生物学 > 微生物组学

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