材料与试剂
一、耗材
- 一次性培养皿 (江苏康健医疗用品,90 mm)
- 八连管 (Life Technologies Corporation, catalog number: 4316567)
- 量筒 (南京梅林学海生物科技有限公司,catalog number: 1601)
- 移液枪枪头 (国产-耗材,catalog number: JWD-MTB1250-5)
- 离心管 (康健医疗,catalog number: KJ307)
- 玻璃棒 (上海阿拉丁生化科技股份有限公司,catalog number: g6034-05-40ea)
- 育苗盘 (54 cm × 28 cm × 4 cm,济阳县帝悦明商贸有限公司)
- 盆钵 (35 cm × 25 cm × 10 cm,济阳县帝悦明商贸有限公司)
二、供试菌株
野生型茄科劳尔氏菌Ralstonia solanacearum QL-Rs1115 (GenBank accession GU390462,以下简称青枯菌) 为本实验室于南京市麒麟后村发病番茄植株中分离而得,具有强的致病性 (Wei et al., 2011)。
三、化学试剂
- D-半乳糖 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: 2202002)
- 蜜二糖 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: dre-c14862000)
- 蔗糖 (南京鼎思生物技术有限公司,catalog number: t3032)
- 鼠李糖 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: l130874-500g)
- D-甘露醇 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: c14752000)
- D-核糖 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: c16813700)
- D-木糖 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: e1004245000)
- D-甘露糖 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: e080274-25g)
- 果糖 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: f792500)
- 麦芽糖 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: 098526)
- L-阿拉伯糖 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: e080054-500g)
- 葡萄糖 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: g116302-10kg)
- 酒石酸 (北京偶合科技有限公司,catalog number: 526-83-0)
- 琥珀酸 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: 110-15-6)
- 戊二酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: e080054-500g)
- 乙酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: 044721)
- 丙酮酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: 965275)
- 反乌头酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: a189885)
- 苹果酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: a0107541000)
- 顺丁烯二酸 (北京华威锐科化工有限公司,catalog number: sm14058-2)
- 草酸 (南京捷茂生物科技有限公司,catalog number: o16291-20mg)
- 乳酸 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: l108839-10kg)
- 半乳糖醛酸 (南京鼎思生物技术有限公司,catalog number: t3043)
- 柠檬酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: c521000)
- 瓜氨酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: a070059-100g)
- 谷氨酰胺 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: b020017-100g)
- L-亮氨酸 (无锡必康生物工程有限公司,catalog number: 61-90-5)
- L-丝氨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: s270980)
- β-丙氨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: 044720)
- L-甲硫氨酸 (南京捷茂生物科技有限公司,catalog number: l52980-500g)
- L-脯氨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: p755995)
- L-丙氨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: a481400)
- L-缬氨酸 (南京金益柏生物科技有限公司,catalog number: r008858-500g)
- L-组氨酸 (南京金益柏生物科技有限公司,catalog number: r011864-25g)
- L-色氨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: b673350)
- L-苯丙氨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: 075335)
- 阿魏酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: f308900)
- 水杨酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: s088125)
- 没食子酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: e1000010250)
- 邻苯二甲酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: frs-067n)
- 苯甲酸 (南京金益柏生物科技有限公司,catalog number: r011542-10ml)
- 丁香酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: s920025)
- 香草酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: a0100155000)
- 肉桂酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: a0100280250)
- 绿原酸 (上海百灵威化学技术有限公司,catalog number: c366540)
- 香豆酸 (南京杰汶达生物科技有限公司,catalog number: rq1324)
- 羟基苯甲酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: a0100540250)
- 咖啡酸 (南京晶格化学科技有限公司,catalog number: a0106610050)
- 葡萄糖 (南京瑞翼特生物科技有限公司,catalog number: g116302-10kg)
- 蛋白胨 (南京巨优科学器材有限公司,catalog number: 79662B)
- 酵母粉 (南京沃华生物科技有限公司,catalog number: cm0019)
- 牛肉膏 (北京华威锐科化工有限公司,catalog number: hwg56062)
- 次氯酸钠 (南京晚晴化玻仪器有限公司,catalog number: s817439-500ml)
- 氢氧化钠 (南京晚晴化玻仪器有限公司,catalog number: s111498-500g)
- 甲醇 (南京晚晴化玻仪器有限公司,catalog number: m116118-4l)
- PowerSoil DNA提取试剂盒 (Mo Bio, Carlsbad, CA, USA)
- SYBR Premix Ex TaqTM 试剂盒 (宝生物工程有限公司, 大连)
四、培养基与缓冲液 (见溶液配方)
- NB培养基 (Nutrient Broth)
- M-SMSA培养基 (Modified Selective Medium South Africa)
五、植物与育苗基质
- 番茄种子 (品种:合作903)
- 育苗基质 (淮安农业技术发展有限公司,淮安,江苏)
仪器设备
- 恒温摇床 (MIN QUAN, MQD-BIR)
- 酶标仪 (SpectraMax M5, Sunnyvale, CA, USA)
- -80 °C冰箱 (海尔,立式超低温保存箱,DW-86L626)
- 移液枪 (Eppendorf Research plus)
- 涡旋仪 (SCIENTIFIC INDUSTRIES, USA)
- 7500 Fast Real-Time PCR系统 (Applied Biosystems, CA, USA)
- NanoDrop (ThermoScientific, Wilmington, DE, USA)
软件和数据库
- RStudio (version3.1.2)
- IBM SPSS Statistics (version26)
- Mothur (versionv.1.35.1)
- QIIME (version2.0)
实验步骤