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环境样本中的细菌总量测定——流式细胞法

Quantification of Bacterial Biomass from Environmental Samples -- Flow Cytometry

张 张照婧
邓 邓晔
王尚 王尚

发表时间: 2021年04月27日 DOI: 10.21769/BioProtoc.2003700 浏览次数: 4946

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微生物组实验手册：架起各领域通向微生物组世界的桥梁
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摘要：自然界中微生物群落有着极高的分类多样性和代谢潜力，对微生物群落进行定量分析在一定程度上可以作为反映主要生态过程的重要生物学指标。流式细胞法 (FCM) 是一种强有力的直接细胞计数方法，可以分辨环境样本中的活性细菌和非活性细菌，并且更准确地了解其中的实际细菌总量。FCM定量方法适用于不同环境，但是需要进行适当的样品预处理和荧光染色。

Keywords: 流式细胞法 search 细菌定量 search 样品预处理 search 荧光染色 search

材料与试剂

  1.  SYBR Green I (SYBR-I, 10000×, Invitrogen, USA)
  2.  碘化丙啶 (Propidium iodide, PI, Invitrogen, USA)
  3.  二甲基亚砜 (DMSO)
  4.  BD FALCON细胞筛网 (40 μm, catalog number: 352340)
  5.  BD绝对计数管 (BD TrucountTM Tubes, BD Biosciences)

仪器设备

  1. 流式细胞仪 (BD FACSCalibur, USA) (图1)


    图1. BD FACSCalibur流式细胞仪

软件

  1.  分析软件：BD CellQuest Pro Software (User Guide: https://www.einstein.yu.edu/uploadedFiles/Facs/CellQuestProUsersGuidefromBD.pdf?n=8832)

实验步骤

Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：张照婧, 邓晔, 王尚. (2021). 环境样本中的细菌总量测定——流式细胞法. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003700. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003700.
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How to cite: Zhang, Z. J., Deng, Y. and Wand, S. (2021). Quantification of Bacterial Biomass from Environmental Samples -- Flow Cytometry. // Microbiome Protocols eBook. Bio-101: e2003700. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003700.
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分类

系统生物学 > 微生物组学

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