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小麦相关微生物的野外采样与样品保存

Field Sampling and Sample Storage of Wheat-associated Microbiomes

马 马玉颖
褚 褚海燕

发表时间: 2021年04月22日 DOI: 10.21769/BioProtoc.2003668 浏览次数: 2705

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微生物组实验手册：架起各领域通向微生物组世界的桥梁
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摘要：植物的根、茎、叶、花、果实等各组织器官表面和内部都定殖着复杂且多样的微生物。由于对环境和植物状态具有高度的敏感性，这些植物相关的微生物群落在野外环境条件下时刻维持着相对动态的平衡。因此，对于处于复杂环境中的田间/野外植物相关微生物的研究，需要注意在植物样本获取中的及时处理，尽可能地减少植物组织及其相关微生物显著的变化。本文以田间小麦相关微生物的研究为例，利用液氮速冻、干冰运输以及低温保存等方式，详述了对田间小麦植株样本的采集、运输、处理、保存过程及注意事项，为更好地保持野外小麦植株样品 (根、茎、叶等) 在采集时的原状态，维持其中相关微生物群落的稳定提供基础方法指导，以供后续进行小麦植株相关性状指标的测定，及其小麦相关微生物DNA的提取和研究。

Keywords: 小麦 search 植物微生物 search 野外采样 search 样品保存 search

材料与试剂

  1.  一次性无菌手套 (AMMEX, catalog number: TLFCMDSi42100)
  2. 无菌滤纸
  3. 密封袋
  4. 标签
  5. 氧化锆珠 (南京东晟美生物科技有限公司，Zirconia beads, 5mm)
  6. 10 ml离心管 (biosharp, micro-centrifuge tube, catalog number: S-100-M)
  7. 小麦植株
  8. 液氮
  9. 干冰
  10. 无菌水

仪器设备

  1. 铁锹
  2. 剪刀
  3. 铅笔
  4. 记号笔
  5. 空泡沫盒
  6. 干冰箱 (装有干冰的泡沫箱)
  7. 液氮罐 (南京天玮地络仪器设备有限公司，catalog number: LD25)
  8. 毛刷 (VICO, catalog number: WK82215)
  9. -40 °C冰箱 (Haier, catalog number: DW-40L508)
  10. -80 °C超低温冰箱 (Thermo Fisher Scientific, model number: 907)
  11. 高通量快速研磨机 (上海净信，JXFSTPRP系列全自动样品快速研磨仪)

实验步骤

Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：马玉颖, 褚海燕. (2021). 小麦相关微生物的野外采样与样品保存. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003668. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003668.
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How to cite: Ma, Y. Y. and Chu, H. Y. (2021). Field Sampling and Sample Storage of Wheat-associated Microbiomes. // Microbiome Protocols eBook. Bio-101: e2003668. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003668.
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分类

系统生物学 > 微生物组学

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