Improve Research Reproducibility A Bio-protocol resource

野外树木根系取样及根际土收集操作规程

Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields

何 何兴华
杨 杨预展
袁 袁志林

发表时间: 2021年03月25日 DOI: 10.21769/BioProtoc.2003655 浏览次数: 6890

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微生物组实验手册：架起各领域通向微生物组世界的桥梁
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摘要：微生物在林业生产力中发挥着越来越重要的作用，树木根系与土壤微生物交流非常密切，并且树木根系可与多种类型微生物 (根际促生菌、外生菌根真菌和丛枝菌根真菌等) 建立共生关系 (图1)。为了方便研究植物-微生物的互作机制，本文描述了野外树木根系采集和根际土收集的具体方法，即获得树木根系样品后，在缓冲液中震荡，去除根系，最后离心获得根际土。从而方便开展后续菌群组成和结构分析，以及分离纯化菌株等研究。

Keywords: 树木 search 根系取样 search 根际土收集 search


 
图1. 杨树地上地下部分共生菌类型 (图片引自潘雪玉，2018)

材料与试剂

  1. 标签纸
  2. 采样记录表
  3. 冰袋或干冰
  4. 无菌采样袋
  5. 油性记号笔
  6. 50 ml离心管
  7. 一次性无菌乳胶手套
  8. NaCl (国药集团化学试剂有限公司，沪试，catalog number: 7647-14-5)
  9. Na2HPO4 (国药集团化学试剂有限公司，沪试，catalog number: 20040618)
  10. NaH2PO4 (国药集团化学试剂有限公司，沪试，catalog number: 20040818)
  11. 10 mM PBS溶液 (见溶液配方)

仪器设备

  1. 铁铲
  2. 取土钻
  3. 修枝剪
  4. GPS定位器 (南京君灿仪器设备有限公司，彩途，model: K82B)
  5. 生物样品采样箱
  6. 小锄头 (中间半椭圆豁口)
  7. 全温振荡器 (苏州培英实验设备有限公司，培英，model: THZ-C-1)
  8. 台式高速冷冻离心机 (Sigma公司，Sigma，model: 3K15)

实验步骤

Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：何兴华, 杨预展, 袁志林. (2021). 野外树木根系取样及根际土收集操作规程. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003655. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003655.
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How to cite: He, X. H., Yang, Y. Z. and Yuang, Z. L. (2021). Protocol for Sampling of Root and Rhizosphere Soils from Trees in Natural Fields. // Microbiome Protocols eBook. Bio-101: e2003655. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003655.
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分类

系统生物学 > 微生物组学

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