Methods for the Preparation of Microbiome in Water-stable Soil Aggregates

摘要：土壤团聚体是土壤结构的基本单位，其数量多少、粒径比例及稳定性与土壤物质循环、养分供应、持水性等息息相关。然而，针对土壤团聚体微生物组的研究还比较少。真菌、细菌可通过物理、化学等作用能促使土壤团聚体的形成及稳定，而土壤团聚体能为真菌、细菌等微生物提供良好的栖息环境。本方法针对土壤水稳性团聚体微生物组学研究，通过自身研究经历结合其它文献报道，详细论述土壤水稳性团聚体微生物组研究样本的制备方法，主要为湿筛法。通过改进传统的湿筛法(在水的作用下使土壤颗粒或团聚体分散并进行大小分级)，用不同粒级的套筛在无菌水中筛分不同粒径的水稳性团聚体，最后提取不同粒径团聚体的DNA，用高通量测序手段测定不同粒径团聚体的微生物群落结构。无论是湿筛法还是干筛法都可能会对原有微生物组的种群分布造成一定影响，本文将详细讲述如何在水稳性团聚体样本制备过程中最大程度的避免团聚体筛分过程对微生物的影响。

分类