Improve Research Reproducibility A Bio-protocol resource

窖泥样品采集与核酸提取

Sample Collection and Nucleic Acid Extraction of Pit Mud

王 王雪山
杜 杜海
徐 徐岩

发表时间: 2021年01月10日 DOI: 10.21769/BioProtoc.2003386 浏览次数: 2491

返回专辑目录

微生物组实验手册：架起各领域通向微生物组世界的桥梁
pdf PDF PDF
ask 提问与回复
引用
收藏
被引用
摘要：中国白酒是世界六大蒸馏酒之一，其酿造过程独特，涉及多种微生物的相互作用及代谢。白酒酿造环境已经成为一种我国独有的特殊生态环境，受国内外的广泛关注。浓香型白酒是中国白酒三大香型之一，窖泥是浓香型白酒特征性风味物质-己酸乙酯代谢必不可少的环境。本方法针对窖泥特殊的厌氧环境，采用厌氧袋完成窖泥样品的采集，并进行窖泥宏基因组的提取及保存。本方法对研究白酒酿造微生物多样性及功能有重要价值。

Keywords: 中国白酒 search 窖泥 search 样品采集 search 宏基因组提取 search

材料与试剂

  1. 厌氧产气袋 (MGC/三菱瓦斯化学，catalog number: C-11) 
  2. 自封袋 (Asone/亚速旺，catalog number: ASO-4-536-07) 
  3. 枪头 (碧云天Beyotime, catalog numbers: FTIP010, FTIP200, FTIP01C) 
  4. 离心管 (Nest/耐思，catalog numbers: 602052, 620011, 615001) 
  5. Parafilm封口膜 (Parafilm, catalog number: PM996) 
  6. 玻璃珠 (425~600 μm) (Solarbio/索莱宝，catalog number: G8080-100g) 
  7. 10% SDS Solution (Macklin/麦克林，catalog number: D885207-250ml) 
  8. NaCl (国药集团化学试剂有限公司，中国，分析纯)
  9. Tris-HCl (pH 8.0) (Macklin/麦克林，catalog number: D885212-250ml) 
  10. 三水合乙酸钠 (Macklin/麦克林，catalog number: S817983-500g) 
  11. Tris饱和酚 (pH > 7.8) (上海源叶，catalog number: R21022-100ml) 
  12. 氯仿 (国药集团化学试剂有限公司，中国，分析纯) 
  13. 异戊醇 (国药集团化学试剂有限公司，中国，分析纯) 
  14. 无水乙醇 (国药集团化学试剂有限公司，中国，分析纯) 
  15. RNase A (Solarbio/索莱宝，catalog number: R8021-25) 
  16. DEPC水 (上海源叶，catalog number: S30710-500mL) 
  17. 琼脂糖 (BIOWEST，catalog number: 111860) 
  18. Buffer Z缓冲液 (见溶液配方) 
  19. 3 mol/L NaAc溶液 (pH 5.2) (见溶液配方)

仪器设备

  1. 移液枪 (Eppendorf/艾本德, 货号：3120000267\3120000305\3120000224)
  2. 离心机 (Eppendorf/艾本德，model: 5804) 
  3. 制冰机 (斯科茨曼，model: AF103AS) 
  4. 超低温冰箱 (THERMO/赛默飞，model: ULTS1490) 
  5. BeadBeater珠磨式研磨器 (Biospec, catalog number: 3110BXEUR) 
  6. 电泳仪 (Bio-Rad/伯乐，catalog number: 164-5050) 
  7. 凝胶成像仪 (MIULAB/米欧仪器，catalog number: GIS-500) 
  8. NanoDrop 8000分光光度计 (THERMO/赛默飞，catalog number: YQ1633128264) 
  9. pH计 (Asone/亚速旺，catalog number: C1-054-01)

实验步骤

Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：王雪山, 杜海, 徐岩. (2021). 窖泥样品采集与核酸提取. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003386. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003386.
ris ris 下载引用格式
How to cite: Wang, X. S., Du, H. and Xu, Y. (2021). Sample Collection and Nucleic Acid Extraction of Pit Mud. // Microbiome Protocols eBook. Bio-101: e2003386. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003386.
ris ris Download Citation in RIS Format

分类

系统生物学 > 微生物组学

您对这篇实验方法有问题吗？

在此处发布您的问题，我们将邀请本文作者来回答。同时，我们会将您的问题发布到Bio-protocol Exchange，以便寻求社区成员的帮助。

post 发布问题
0 Q&A