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小鼠粪便样本中16S拷贝数的定量检测

Quantitative Analysis of 16S rRNA Gene Copies in Mouse Fecal Sample

刘 刘红宾
吕 吕青青
戴 戴磊

发表时间: 2020年12月25日 DOI: 10.21769/BioProtoc.2003368 浏览次数: 8113

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微生物组实验手册：架起各领域通向微生物组世界的桥梁
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摘要：16S rRNA基因和宏基因组测序技术是研究肠道菌群结构与功能的重要手段，由此可以获取微生物群落的结构和功能组成信息；然而，二者得到的数据均为相对丰度类型，大大削弱了不同样品间的可比性，也难以揭示生物量水平的菌群结构和功能变化。本文旨在运用实时荧光定量PCR技术 (Real-time PCR) 技术对小鼠粪便中的16S rRNA基因进行定量检测，为准确分析肠道菌群的结构提供技术参考。

Keywords: 16S rRNA基因 search 绝对定量 search 肠道菌群 search

材料与试剂

试剂：

  1. 高保真酶 (PrimeSTAR, TAKARA, catalog number: R045A)
  2. TB Green酶 (TAKARA, catalog number: RR820A)
  3. Omega胶回收试剂盒 (Omega, catalog number: D2500-01)
  4. 琼脂糖
  5. 引物
    (27F-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG, 1541R-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA; 331F-TCCTACGGGAGGCAGCAGT, 797R-GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTT) (Jian等，2016)

仪器设备

  1. Nanodrop 2000
  2. 电泳仪
  3. 普通PCR仪 (Bio-read)
  4. 荧光定量PCR仪 (Bio-read)

实验步骤

Copyright: © 2020 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：刘红宾, 吕青青, 戴磊. (2020). 小鼠粪便样本中16S拷贝数的定量检测. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003368. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003368.
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How to cite: Liu, H. B., Lv, Q. Q. and Dai, L. (2020). Quantitative Analysis of 16S rRNA Gene Copies in Mouse Fecal Sample. // Microbiome Protocols eBook. Bio-101: e2003368. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003368.
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分类

分子生物学 > RNA > qRT-PCR

微生物学 > 微生物-宿主相互作用 > 细菌

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