摘要: DNA损伤及细胞衰老时,一些染色质片段会从细胞核中逸出来进入细胞质,该胞质染色质片段上带有H3K9me3蛋白及DNA损伤标志物rH2AX蛋白(Chien
et al., 2011; Ivanov
et al., 2013; Dou
et al., 2015)。它使细胞产生一系列应激反应,形成复杂的网络信号调控通路(Wiley
et al., 2016; Liu
et al., 2018; Vizioli
et al., 2020)。在已知的经典信号通路的基础上,为揭示维持基因组稳定性的新调节因子,我们应用高通量全基因组siRNA筛选技术,在全基因组范围内对所有编码蛋白的基因进行干扰并检测胞质内游离染色质片段出现的频率。。通过免疫荧光实验对胞质染色体片段进行rH2AX和H3K9me3染色标记,并对细胞进行DAPI染色,结合高内涵仪器自带的软件对拍摄的照片进行分析,分别计算DAPI、rH2AX和H3K9me3单阳性及三阳性的胞质染色质片段数目,并计算三阳性的胞质染色质片段数目占细胞总数百分比,找出百分比具有明显变化的基因。该方法优势主要是涵盖范围广(包括全基因组基因),并且利用高内涵高通量仪器进行自动拍照和分析,能极大程度加快实验进度,提高结果分析精确度并减少误差。