摘要:在大规模初筛结束后,需要将阳性孔的试剂挑选出来组成一个新的亚库,进行第二轮的复筛验证,这个过程涉及定制文库的制备。另外,当初筛的对象不是整个文库,而是散在分布在整库中的一系列孔时,也需要制备定制亚文库用于筛选。本文将以ORF过表达质粒亚文库的定制流程为例,介绍如何从全基因组ORF过表达文库中挑选出感兴趣的质粒,制备成各孔浓度一致、可直接用于整板细胞转染实验的质粒亚文库。此流程同样适用于化合物库、siRNA文库及sgRNA文库等点阵式文库的亚文库定制,具体移液参数可依据不同加样体积及液体性质略作改动。
材料与试剂
- 96孔U底板 (Costar, catalog number: 3879)
- 50 μl透明吸头 (Perkin Elmer, catalog number: 6001263)
- 可撕铝膜 (安捷伦PlateLoc,catalog number: 24210-001)
- 全基因组ORF文库 (CCSB-Broad Lentiviral Expression Library,Horizon,-80 °C保存)
- OptiMEM (Gibco,catalog number: 31985070)
仪器设备
- 离心机 (Eppendorf, catalog number: centrifuge 5810R)
- Multidrop自动分液器 (Thermo, catalog number: Multidrop Combi)
- Handler workstation自动工作站系统* (Perkin Elmer, catalog number: HANDLER WORKSTATION SX 15)
a. UV灯
b. HEPA
c. Janus液体工作站 (8通道独立吸头)
d. WinPREP®控制软件 (版本号:4.10.0.54)
注:仅列出系统在本实验中用到的部分仪器设备
- 封膜机 (安捷伦PlateLoc)
实验步骤
Copyright: © 2021 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
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