KAPA建库试剂盒在通用方法学中的应用 下一代测序技术 (NGS),又称为大规模平行测序技术,通常指第二代和第三代测序技术,与一代测序技术相比,其在测序速度以及成本上的优势使得该技术在各个领域得以迅速应用。
按所测序核酸分子的类型不同,NGS文库类型可分为DNA 文库—全基因组测序 (WGS)、全外显子组测序 (WES), 染色质免疫沉淀测序 (ChIP-seq);RNA文库—全转录组测序, RNA免疫沉淀测序 (RIP-seq)。 KAPA NGS系列产品可覆盖所有类型文库构建应用。
本文介绍使用KAPA DNA HyperPlus构建野生玉米群体全基因组文库,通过对群体基因组的测序来揭示遗传变异的多样性,实现作物农艺性状与基因型的关联分析,从某种程度上可称为高通量的QTL来定位控制某性状的基因。
研究背景
基因组结构变异会对基因的表达和生物个体的性状表现产生直接的影响,通过高通量测序分析野生玉米RIL群体的全基因组结构变异,以动态的分析基因组变异,遗传多样性,为选择目标基因研究玉米重要的农艺性状提供数据基础。
生物材料:玉米叶片基因组DNA
起始DNA量:500 ng (Qubit定量)
实验目的
利用KAPA DNA HyperPlus构建二代测序文库,分析野生玉米RIL群体全基因组结构变异。
关键词:玉米,二代测序,文库构建,全基因组分析
实验步骤