实验名称：利用二代测序技术检测甲状腺癌症病人基因突变
产品名称：KAPA hyperplus建库试剂盒

[KAPA NGS产品在肿瘤研究中的应用] 下一代测序技术 (NGS)，又称为大规模平行测序技术，与一代测序技术相比，其在测序速度以及成本上的优势使得该技术在肿瘤诊断 (肺癌、结肠癌、乳腺癌、胃癌) 及个体化用药治疗上的应用变为可能。
        构建高质量文库是运用NGS技术进行科学/临床研究的第一步也是非常关键的一步。进行肿瘤研究的文库类型主要有以下5种：全基因组测序 (WGS) (针对DNA)、全外显子组测序 (WES) (针对DNA)、全转录组测序 (针对RNA的RNA-seq)、 表观组测序 (甲基化及ChIP-seq)和靶向靶标测序 (DNA和RNA)。
        在科研及临床研究中，用于肿瘤相关研究的原始样品主要包括：FFPE样品、体液、单细胞、游离核酸等。从样品中分离出的用于文库构建的核酸起始样品量比较低 (通常1 ng 到几百ng 不等)，且核酸分子质量不高 (降解、损伤)。这些都对构建达到测序标准的高质量文库提出了挑战。
        Roche KAPA文库制备试剂为通过NGS进行肿瘤研究提供了整套解决方案 (Roche Dialog，罗氏诊断在华推广KAPA NGS新一代测序系列产品完善基因检测解决方案)。KAPA人类基因组DNA定量及QC试剂盒可以在单次检测中同时评估样本量及样本质量，严防谨守助力深度测序；Roche DNA文库构建试剂盒 (KAPA HyperPrep Kit, KAPA HyperPlus Kit) 及RNA文库构建试剂盒 (KAPA RNA HyperPrep Kit) 等试剂盒具有操作极简 (一管到底)，建库快速 (单日内可完成)，文库质量和得率双高等优点；文库定量试剂盒 KAPA Library Quant Kit质量同监，为测序把好最后一道关；而mRNA-capture Kit、RNA-Seq with RiboErase和纯化磁珠对目标核酸分子的富集可有效降低测序成本。这些试剂盒可有效帮助用户获得稳定可靠的测序结果，为后期的科学实验验证及临床研究提供可信的数据依据。 (测序中国, 案例解析： 定向进化的KAPA酶，从困难样本获得高质量NGS数据的“灵魂”)

研究背景

甲状腺癌症的辅助检测方式包括B超检查， CT及MRI检查，血清甲状腺球蛋白浓度检等等。但均有其自身的局限性。如血清甲状腺球蛋白是组织特异性，非癌症特异性。而CT扫描会导致患者反复接触电离辐射，限制了它在临床上的应用。循环肿瘤DNA (ctDNA)已被证明是很多实体瘤中的生物标志物, 在甲状腺癌症中是否可以用血浆中的ctDNA作为肿瘤标志物，目前尚未有明确得结论。

生物材料：甲状腺癌组织样品 (FFPE 样品，H&E 染色样品切片及未染色切片)

实验目的

通过构建不同甲状腺癌病人的基因组文库，分析甲状腺癌变组织中基因发生突变的情况，以为ctDNA 是否能作为甲状腺癌标志物提供序列支持。

关键词： DNA，二代测序，甲状腺癌，ctDNA，cfDNA

实验步骤