实验名称：胃癌类器官与胃癌患者各组织的全外显子组及表达谱相似度
产品名称：KAPA HyperPrep 试剂盒及KAPA Stranded mRNA-Seq 试剂盒

[KAPA建库试剂盒在生物样本库中的应用] 生物样本库是融合生物样本实体、生物分子信息以及样本表型数据的综合资源的一项系统工程，对于开展人类疾病预测、诊断、治疗研究具有不可替代的重要作用。转化医学的兴起和发展对生物样本资源的迫切需求与日俱增，对生物样本库的数量和质量也提出了更高的要求。而二代测序技术的蓬勃发展，为生物样本库的开发提供了更加有力的支持。全基因组、全外显子组、转录组、表观遗传组等测序结果，不仅可以帮助我们得知取得的生物样本的质量，构建的实验模型是否能够真实地反应现实状况，而且还可以进一步地在药物筛选、药物作用机制、疾病亚型及治疗靶点等方面发挥作用。KAPA NGS建库产品即用体系，简单流程，适用批量处理，全面支持多个自动化平台的特点，为通过二代测序技术进一步开发生物样品库的应用提供了保障。

研究背景

胃癌有明显的分子异质性，具有侵袭力强和易抗药的特点。因此，构建良好的体外模型，包括独特的亚型是极为重要的。本研究中建立了一个胃癌类器官生物库，包括34名患者的正常、发育不良、癌症和淋巴结转移组织，并且34名患者中包括大多数已知的分子亚型 (包括EBV、MSI、肠道/CIN和弥漫性/GS，具有CLDN18-ARHGAP6或CTNND1-ARHGAP26融合或RHOA突变)，通过构建胃癌类器官和胃癌患者各组织的外显子和转录组文库，分析得到即使经过长时间培养，类器官仍然能与患者组织在形态、转录组和基因组图谱方面保持不变。大规模药物筛选显示类器官对最近批准或临床试验中的药物敏感，包括那帕布林、阿贝马西利布和ATR抑制剂VE-822。因此，构建的胃癌类器官生物库对胃癌的研究和治疗都具有重大的意义和价值。

生物材料：人胃癌类器官和人胃癌组织

实验目的

分别利用KAPA Hyper Prep试剂盒和KAPA Stranded mRNA-Seq试剂盒构建胃癌类器官和胃癌患者各组织的全外显子文库和转录组文库，分析二者的外显子组和表达谱差异，验证构建的类器官是否能够还原真实的胃癌组织情况。

关键词：胃癌，类器官，全外显子组，表达谱，WES，RNA-seq

实验步骤