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染色质免疫沉淀

Chromatin Immunoprecipitation

姚 姚艳
黄 黄勋

发表时间: 2019年06月20日 DOI: 10.21769/BioProtoc.1010273 浏览次数: 4591

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果蝇实验手册
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摘要：染色质松紧状态会影响基因的表达水平，染色质修饰因子及转录因子可以与相关 基因的启动子区域相结合，通过ChIP (Chromatin immunoprecipitation) 以及qPCR 可以检测其相互作用 (Yao等，2018)。

Keywords: 果蝇 search 脂肪体 search 染色质免疫沉淀 search

材料与试剂

  1. 移液枪头
  2. 离心管
  3. (可选) 过滤除菌器
  4. 果蝇三龄幼虫
  5. 多聚甲醛
  6. 125 mM甘氨酸
  7. RNase A
  8. 蛋白酶K (20 mg/ml)
  9. 琼脂糖珠子
  10. PMSF
  11. Protease Inhibitor Cocktail (Roche)
  12. IgG (BioSS) 
  13. 抗体 (根据实验需要)
  14. PCR纯化试剂盒 (QIAGEN) 
  15. (可选) 无水乙醇
  16. LiCl
  17. NP-40
  18. Sodium deoxycholate
  19. EDTA
  20. Tris-HCl, pH 8.0
  21. SDS
  22. NaCl
  23. Triton X-100
  24. KCl
  25. Na2HPO4
  26. KH2PO4
  27. RIPA裂解液 (见溶液配方)
  28. RIPA缓冲液 (含350 mM NaCl) (见溶液配方)
  29. 1× PBS缓冲液 (见溶液配方)
  30. TEL缓冲液 (见溶液配方)
  31. TE缓冲液 (见溶液配方)
  32. 洗脱缓冲液 (见溶液配方)

仪器设备

  1. 移液枪
  2. 震荡仪
  3. 超声破碎仪
  4. 冷冻离心机
  5. -80 °C冰箱
  6. -20 °C冰箱
  7. 旋转摇床
  8. 金属浴锅
  9. 高压蒸汽灭菌

实验步骤

Copyright: © 2019 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：姚艳, 黄勋. (2019). 染色质免疫沉淀. Bio-101: e1010273. DOI: 10.21769/BioProtoc.1010273.
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How to cite: Yao, Y. and Huang, X. (2019). Chromatin Immunoprecipitation. Bio-101: e1010273. DOI: 10.21769/BioProtoc.1010273.
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分类

分子生物学 > DNA

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