mRNA-seq Analysis

摘要：mRNA-seq是通过逆转录过程将细胞产生的RNA转化为DNA (cDNA，互补，并对获得的cDNA进行文库构建)。然后对得到的DNA进行测序，并从观察到的特定DNA丰度中，从中推断细胞中mRNA的原始量。大多数mRNA-seq分析的目标是找到在实验条件下转录水平发生变化的基因或转录本，即差异表达。通过找到这些基因和转录本，我们可以推断出不同条件的功能特征。mRNA-seq通常建议的每种状态最小生物学重复次数为3次，5次更好。如果预期到结果可能差异微妙或者生物变异显着时 (例如对活体动物进行实验)，需要更多的重复。所以，一组实验 (对照组和实验组) 意味着会有6~10个样品，产生6~10个或者更多fastq文件。所以能够明确以及流程化分析过程十分重要。

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