Improve Research Reproducibility A Bio-protocol resource

DNA甲基化检测

Detection of DNA Methylation by Bisulfite-sequencing, Restriction Enzyme Digestion-PCR and Restriction Enzyme Digestion-Sourthern

陈 陈香嵩
程 程赛凤
周 周超
刘 刘潜
赵 赵毓

发表时间: 2018年05月02日 DOI: 10.21769/BioProtoc.1010110 浏览次数: 18044

返回专辑目录

Rice Protocol eBook
pdf PDF PDF
ask 提问与回复
引用
收藏
被引用
方法一: 重亚硫酸盐测序 (Bisulfite-sequencing)

实验原理：以重亚硫酸盐处理基因组DNA，发生甲基化的胞嘧啶不变，而未甲基化的胞嘧啶会变成尿嘧啶，经过PCR扩增，原本的C/G就变成T/A，可以通过测序区分。该方法检测精确，分辨率最高，但耗时耗力，通量有限。
实验目的：一般以下情况可以用此方法：精细定量检测目标区段的DNA甲基化情况；结合高通量测序检测全基因组DNA甲基化情况。

Keywords: DNA甲基化 search 高通量测序 search 重亚硫酸盐 search

材料与试剂

  1. PCR管
  2. 各种型号枪头 (20 μl, 200 μl, 1 ml)
  3. 高质量基因组抽提试剂盒，常用的如DNeasy plant mini kit
  4. 重亚硫酸盐处理试剂盒，常用的如EpiTect Bisulfite Kit (QIAGEN, catalog number: 59104)

仪器设备

  1. PCR仪
  2. 移液器
  3. 离心机
  4. 水浴锅

实验步骤

Copyright: © 2018 The Authors; exclusive licensee Bio-protocol LLC.
引用格式：陈香嵩, 程赛凤, 周超, 刘潜, 赵毓. (2018). DNA甲基化检测. Bio-101: e1010110. DOI: 10.21769/BioProtoc.1010110.
ris ris 下载引用格式
How to cite: Chen, X. S., Cheng, S. F., Zhou, C., Liu, Q. and Zhao, Y.  (2018). Detection of DNA Methylation by Bisulfite-sequencing, Restriction Enzyme Digestion-PCR and Restriction Enzyme Digestion-Sourthern. Bio-101: e1010110. DOI: 10.21769/BioProtoc.1010110.
ris ris Download Citation in RIS Format

分类

系统生物学 > 表观基因组学 > DNA 甲基化

分子生物学 > DNA > DNA 修饰

分子生物学 > DNA > PCR

您对这篇实验方法有问题吗？

在此处发布您的问题，我们将邀请本文作者来回答。同时，我们会将您的问题发布到Bio-protocol Exchange，以便寻求社区成员的帮助。

post 发布问题
0 Q&A